蓝泽耕作离开了翔阳大学附属北部医院的急救中心，成为了一名神经外科医生。白石惠依然在人手不足的急救中心担当着领导者的角色。曾经也梦想成为飞行急救医生的绯山美帆子离开翔阳医院，成为了妇产科医生。冴岛遥依然从事着飞行急救护士的工作。藤川一男与白石一起留在急救中心，成为了一名整形外科的急救医生。

　　“医龙”再次归来！完成了日本第一例Batista手术收入后，由朝田龙太郎（坂口宪二饰）率领的小队就被解散了。朝田回到了难民营，继续他的国际救援。之前任职的明真大学，格局也有所变化。前小组成员伊集院登（小池彻平饰）、里原美纪（水川麻美饰）等虽然还留守医院，但都因医院的情况精神不佳。　　这时，一封不知来历的邮件发到了前小组成员的手上。邮件的内容是希望重组医龙小队。这个信息让小组的成员都感到既兴奋又忐忑。这时一位患者被送到医院，由龙太郎适时挽救了生命。借此机会，医龙小队又再次组建，一切都朝着好的方向发展着。但朝田似乎隐隐感觉着背后有人在操纵着这些事……

故事描述日本通过法案开始建构全国救护直升机体系，使空中医师的需求大增。本剧即以急救中心作为舞台，描绘年轻的实习飞行医生和指导医生们的互动关系，以及在直升机里病患和参与人们的奋斗跟纠纷。翔阳大学附属的北部医院急救中心是首间成立飞行急救队的医院，四位年轻的研修医生选择在此学习，希望能成为出色的医生。该剧从第一季结束后的一年半开始，蓝泽、白石、绯山和藤川四名年轻的医生在工作中逐渐成长。恩师黑田医生因为断臂而离开医院，出现在他们面前是更加严格的医师橘启辅。

　　《紧急救命》里的菜鸟实习医生们，不再是刚来时手忙脚乱的样子，各人都有了不小的成长和变化，也加深了困惑。蓝泽（山下智久饰）纠结于家庭；白石（新垣结衣饰）看似变得自信，实则仍对牵连黑田医生（柳叶敏郎饰）一事感到愧疚；绯山（户田惠梨香饰）因为之前救援意外受伤而留下了伤疤，害怕手术；滕川（前利阳介饰）依然是他们几个当中最一般的人；而护士冴岛（比嘉爱末饰）则和患病的男友面对生死离别。医院方面取代黑田的是新调来的医生桔启辅（椎名桔平饰），和黑田的风格完全不同。新的挑战接踵而来，是去是留依然是个未知数。　　《紧急救命》第二季再开。上一季着重讲他们各自的成长，而到了第二季则更多的讲到了医患关系，经历了不少生离死别和无能为力后，成为医生的初衷是否能经受的住现实的打击，且他们对“医生”一词又有了新的认识。

以成为飞行医生为目标的四名医师，作为实习生一同来到了翔阳大学附属北部医院急救中心赴任。当他们在前辈的带领下在中心内四处查看时，正好有患者被直升机送来，他们开始了对患者的急救。表现出了自己的技术和知识量的蓝泽与白石参加了手术。绯山负责联络73岁患者的家属，藤川则负责对年轻的少女·糖尿病患者美树进行检查。飞行医生黑田负责指导实习生，下午白石则要登上直升机。收到了需要直升机的请求，白石按照预定计划赶往现场。但由于过于紧张，没能做好处理，让她十分消沉。在中心，正要开始对送来的患者进行处理，然而白石还是无法从现场的失态中恢复心情，蓝泽对她伸出了援手。

特别篇继续延续着第一季的故事。没有听从指挥的实习生五人组蓝泽耕作（山下智久饰）、白石惠（新垣结衣饰）、绯山美帆子（户田惠梨香饰）、冴岛遥（比嘉爱末饰）和藤川一男（浅利阳介饰）被要求停止工作一周进行反思。这一周里，五人各进行着不一样的事情。因为上一季的意外事故，失去右手的黑田医生（柳叶敏郎饰）则开始进行康复训练。　　回归岗位后的五人组，遇到了列车出轨事故。列车上乘客众多，死伤惨重。实习生们和医生分批乘坐救援飞机奔赴现场。现场一片混乱，生与死的搏斗场，让实习生们只能争分夺秒。并且，灾难似乎也在慢慢靠近实习生中的一员……