原泰久のマンガを佐藤信介が実写化した映画「キングダム」シリーズの3作目となる本作。信と王騎が初めて同じ戦場に立つ「馬陽の戦い」や、秦の国王・嬴政の過去が明らかとなる「紫夏編」が描かれる。

某个工业地带陆陆续续出现怪兽？！弦人队长率领SKaRD进行迎击，打倒了接二连三的怪兽。SKaRD认为此事与该地带在进行怪兽残骸处理和研究的先进化学企业「尼克罗玛斯公司」有某种关系，SKaRD便急行前往该公司的最高运营者、同时也是世界屈指可数的化学研究者的马布塞博士那里进行调查。　　尼克罗玛斯公司的研究所正在开发能够实现与生命根源相关的长生不老物质「达姆特辛」，据说即将完成。在这样的情况下，突然出现了自称「宇宙霸者」的神秘宇宙人「达姆诺星人」！并且，从被破坏的容器中泄露出来的达姆特辛物质吞噬了研究所的怪兽样本，诞生了可怕的巨大怪兽——妖骸魔兽贡吉尔冈。现在，以日本的首都为舞台，布莱泽奥特曼以及SKaRD与大怪兽壮烈的大碰撞帷幕即将拉开！

1638年，因不堪饥荒和针对天主教徒的压迫，日本爆发了岛原之乱，德川幕府派遣十二万大军征讨，大败天草四郎时贞（洼冢洋介饰）统率的岛原军，以妖术闻名的天草在临死前令幕府来将陷入狂乱。多年以后，德川家康的三子、当世将军的叔叔、有南海之龙之称的德川赖宣在打猎时遇见还魂归来的天草以及其侍女（麻生久美子饰），天草怂恿赖宣用实力夺权，并向其展示了借用女性身体为媒介令死者复活的魔界转生之术。天草收集女性做为转生法术载体，将柳生一族拖入了此事，柳生十兵卫（佐藤浩市饰）与天草复活的昔日同门荒木又右卫门恶战并斩断其一臂。天草将宝藏院胤舜、柳生但马守宗矩和宫本武藏等高手先后引入魔界，与柳生十兵卫展开连番搏杀……