时间点为TV版两年后的暑假。海人成为了高中三年生，其他人亦踏出了自己的道路。有天，去了海人家中游玩的哲郎发现了一卷磁带，而当中记录的正是两年前的暑假、拍摄电影前所拍摄的试拍。

夏日的三个月中，热爱摄影、个头矮小的男孩雾岛海人和朋友们打算要拍一部电影，女主角就是神秘转学生三年级的学姊贵月一花，但海人和一花的相遇藏着另一个秘密……天空湛蓝，万里无云。积雨云翻涌，仿佛要将彼岸的山隐藏。这是我们小镇上常见的风景。但是，也是无可替代的“盛夏”。那个男孩有一个模糊的想法，“一无所有却想做点什么”。所以和同伴商量一起拍电影。就在那时，一个“特别”的女孩来到了这个小镇。然后将男孩的想法视为“特别”。男孩的名字是——雾岛海人。女孩的名字是——贵月一花。他们的盛夏开始了。我们在那个盛夏等待——

14岁的天野莓是个可爱的追梦少女，她性格单纯善良（还好吃），从小就很喜欢甜点，渴望成为一名出色的蛋糕师，做出为人们带来快乐的甜点。奈何天不遂人愿，天野莓十分笨拙，那份笨拙程度和她喜欢蛋糕的狂热程度几乎成正比。某天，小莓去参加蛋糕展示会时邂逅了一位金发男性——安利老师，这位老师发现小莓在甜点方面的天赋属于天才级别，于是建议小莓去他祖母创建的甜点学院。安利老师的邀请唤醒了小莓那颗自卑、犹豫不决的心，终于，小莓在经过与家人的激烈讨论后，决定转学去圣玛丽学园。慢慢地，小莓对甜点的知识逐渐丰富起来，还遇见了3位甜点王子，展开了新的生活与爱情……

一天，两个身份特殊的少女（珊瑚和峪嘉）打破了边境“沙洲”的战斗日常，随之而来的还有神秘组织及被操控的“祝福者”，一场守卫“虚无”边境的协作战斗拉开了帷幕。沙洲城内究隐藏了什么？少女身上有什么秘密？深藏在沙洲边境的古老秘密浮出了水面。