达拉克帝国是一个完全只有男人的国家，而美洁尔则是个百分之百的女人国，两边长期以来就互相仇视、战火连连。渡海响是一名机械工，在达拉克帝国中属于地位卑微的三等国民阶级，但在第二季故事中却发现，原来他是从地球移民的第一世代13位的其中之一，第一季潜入“雷号舰”盗取“蛮型机”机器人只是为了面子，不料却碰上美洁尔女人国来袭而被卷入战争中，从此改变了他的命运……

达拉克帝国是一个完全只有男人的国家，而美洁尔则是个百分之百的女人国，两边长期以来就互相仇视、战火连连。渡海响是一名机械工，在达拉克帝国中属于地位卑微的三等国民阶级，但在第二季故事中却发现，原来他是从地球移民的第一世代13位的其中之一，第一季潜入“雷号舰”盗取“蛮型机”机器人只是为了面子，不料却碰上美洁尔女人国来袭而被卷入战争中，从此改变了他的命运……

达拉克帝国是一个完全只有男人的国家，而美洁尔则是个百分之百的女人国，两边长期以来就互相仇视、战火连连。渡海响是一名机械工，在达拉克帝国中属于地位卑微的三等国民阶级，但在第二季故事中却发现，原来他是从地球移民的第一世代13位的其中之一，第一季潜入“雷号舰”盗取“蛮型机”机器人只是为了面子，不料却碰上美洁尔女人国来袭而被卷入战争中，从此改变了他的命运……

达拉克帝国是一个完全只有男人的国家，而美洁尔则是个百分之百的女人国，两边长期以来就互相仇视、战火连连。渡海响是一名机械工，在达拉克帝国中属于地位卑微的三等国民阶级，但在第二季故事中却发现，原来他是从地球移民的第一世代13位的其中之一，第一季潜入“雷号舰”盗取“蛮型机”机器人只是为了面子，不料却碰上美洁尔女人国来袭而被卷入战争中，从此改变了他的命运……

平凡的中学生鹿目圆（悠木碧配音）有一个美满的家庭，在生活中她是个性格温顺又有爱心的好孩子。转学生晓美焰（斋藤千和配音）的出现打破了小圆平静的生活，这个性格酷酷又体弱多病的黑长直少女似乎对小圆有着什么难言之隐。命运中的相遇出现了，小圆在路边救下了一只浑身是伤的奇怪动物，没想到这只动物居然会说人类的语言。它告诉小圆它的名字叫丘比（加藤英美里配音），并且提出了一个特殊的要求，它希望小圆能够和它签订契约成为魔法少女。　　魔法少女是这个世界中一种特殊的存在，她们肩负着和魔女战斗的使命，作为报酬，丘比可以实现她们任意的一个愿望。在战斗的过程中，小圆发现魔法少女这个职业并非故事里所描绘的那么美好，随时有着牺牲的可能。并且，随着战斗的升级，一个关乎于她自己的残酷真相正在逐步的浮出水面。

炎魔（德本恭敏配音）从火焰之中化身而来，他的使命是追捕狩猎从魔界逃脱，散落在世界各处作恶的“魔”。为了完成使命，雪鬼姬（千叶纱子配音）是寒冰的化身，与此同时亦是炎魔的助理，两个性格和身份都截然相反的人之间却有着十足的默契。　　在河童妖怪卡巴艾尔（佐藤介词配音）的帮助和引领之下，炎魔和雪鬼姬来到了人间，成立了炎魔事务所。某日，一位名叫亨利希的德国男子出现在了炎魔的面前，希望炎魔能够帮助她寻找失踪的女儿罗拉，然而，此时此刻的炎魔并不知道的是，他和雪鬼姬因此而陷入了一个充满了绝望亦没有出路的黑暗世界之中。

故事发生在从10年前发生了的“同时多发无气力症”的灾难中恢复的未来型新兴城市绫风市。相隔10年之久，高中生神乡慎与弟弟洵在绫风市遇到了担任绫风市警察署长的哥哥谅。　　而这个时候，在绫风市正发生了各种各样的怪异事件。作为警察署长的神乡谅一直在追查着潜藏在这一连串怪异事件背后的神秘组织。而被卷入某件事件的神乡慎“persona”能力和形态觉醒过来。兄弟们的命运的齿轮现在开始转动……。

神凪和麻（小野大辅配音）出生于使用炎术的名门之家，然而却因为缺乏才能而被父亲神凪严马（小山力也配音）赶出了家门。在一次偶然中，和麻意外遇见了强大的风之精灵王，并与其签订了契约，拥有了风之圣痕，并成为了最强的风术师。　　一晃眼，和麻离开日本已经四年了，当他回到这片称之为故乡的土地之时，他想要拥有的，不过只是平静的生活。某日，和麻遇见了名为神凪绫乃（藤村步配音）的少女，她是神凪一族宗家的长女，亦是下一任宗主。尽管绫乃个性傲娇又迟钝，但和麻还是感受到了隐藏在她内心深处的善良，遂两人开始一起行动，而命运的齿轮亦就此开始转动。

柔泽十（细谷佳正配音）是一个外表凶恶的金发不良少年，但在内心里，十对自己的个性和所作所为十分厌恶。某一天，十突然被一个自称与他有着前世羁绊的叫做堕花雨（広桥凉配音）的诡异少女缠上了。雨是一个标准的电波女，喜欢漫画和手办，常年用刘海遮住脸孔。对于雨的强烈攻势，十一开始十分抗拒，但随着雨的锲而不舍，十渐渐接受了雨神出鬼没的存在。　　说来也怪，自从雨出现后。在十的身边开始发生一些诡异残酷的连续杀人事件，而解决事件的线索均指向了行为怪异的雨，这让十不得不开怀疑其雨的身份来。随着调查的深入，十发现，真相果然与雨有着千丝万缕的联系，而其中蕴藏着的，是有关人扭曲人性的悲哀的故事。

来自异次元的种族MU占领了东京，并将城市隐藏在巨大的防护壁之后，他们欺骗在东京生活的人们他们已经成为世界上仅存的人类。在防护壁之外，名为“TERRA”的反MU组织声势渐渐壮大。某日，在同MU激烈交火之时，一位名为神名绫人（下野紘配音）的平凡少年意外的来到了位于东京湾的地下神殿之中，在这里，绫人见到了巨型机器人“Rahxephon”，并且成为了它的驾驶者。　　在神秘女子的紫东遥（久川绫配音）的带领下，绫人来到了防护壁之外，加入了TERRA，并且在那里遇见了名为如月久远（桑岛法子配音）的女子。MU组织对TERRA发起了进攻，当TERRA的存亡陷入危机之中时，绫人再一次驾驶着Rahxephon，成为了这个组织的救世主。