21世纪末，人类的科技水平已高度发达，克隆人技术和宇宙航行早已实现，不再是梦想。与此同时，许多科学家仍孜孜不倦追索着人类起源的秘密与真相。通过对许多古老文明的考察与对比，科学家伊丽莎白·肖（NoomiRapace饰）和查理·赫洛维（LoganMarshall-Green饰）发现，人类可能是来自一个遥远星系的外星人创造的。在Weyland公司资助下，他们乘坐维克丝（查理兹·塞隆CharlizeTheron饰）所掌管的宇宙飞船普罗米修斯号前往那颗未知的星球。　　经过对当地的考察，地球人的设想成功得到印证。可是他们贸然探查“神的秘密”的行为，也将自己引入万劫不复的深渊……

伊森·亨特（汤姆·克鲁斯饰）和队友们接到了追回三个大杀伤性核武器的任务。眼见任务马上就能完成，但为了挽救其中一位队友卢瑟（文·瑞姆斯饰）的生命，三个核武器被人趁机带走。中情局负责人斯隆女士（安吉拉·贝塞特饰）调来她手下的得意猛将沃克（亨利·卡维尔饰），让他盯着伊森·亨特完成追回核武器的任务。期间，女特工伊尔莎（丽贝卡·弗格森饰）突然出现，伊森·亨特发现，他要面对的并不只是恐怖分子，还有潜藏在政府部门的内鬼。

资深特工伊森·亨特（汤姆·克鲁斯TomCruise饰）也有百密一疏时刻，他在接收最新任务时遭到神秘组织“辛迪加”的暗算落入对方手中。辛迪加是一支由全球各地前特工组成的秘密组织，此前一直被CIA视为空穴来风。在对方成员伊莎·福斯特（丽贝卡·弗格森RebeccaFerguson饰）的帮助下，伊森逃出生天，并及时向威廉?布莱德（杰瑞米·雷纳JeremyRenner饰）汇报了辛迪加确切存在的消息。然而此时布莱德的日子并不好过，他负责的IMF机构因俄罗斯核弹头等事件遭到CIA指控并责令解散。在得知该组织密谋刺杀奥地利总统时，伊森联系上了老搭档班吉·邓恩（西蒙·佩吉SimonPegg饰）展开行动，并于谜样女郎伊莎再度相会。　　接下来的一连串事件中，辛迪加的真面目逐渐揭开，而他们也终于显露出真实的目的……

1974年的英国约克郡，时刻笼罩在一片氤氲雾气之中，空气中弥漫着哀愁和不祥的气息，接连数起儿童绑架案件让约克的气氛愈加压抑起来。年轻气盛的记者埃迪·丹福德（安德鲁·加菲尔德AndrewGarfield饰）对此极为关注，积极展开调查，甚至无暇顾及业已病危的父亲。然而随着调查的深入，他却发现这些并非简单的绑架案，设计政界的黑幕渐渐浮出水面，埃迪也不自觉地为层层危险所包围。浓浓黑雾，难以散去……　　本片改编自DavidPeace的四部悬疑小说（分别以年度为书名：1974、1977、1980、1983，合称RedRidingQuartet），由英国第4频道主持拍摄为三部影片，被称作“血色侦程三部曲”。